El municipio de Cuautitlán Izcalli se ubica al noroeste del Valle de México, en la porción centro - oeste del Estado de México, con las siguientes coordenadas geográficas extremas: latitud máxima 19º43'56" y latitud mínima 19º35'05", longitud máxima 99º17'25" y longitud mínima 99º10'32", con una altitud media sobre el nivel del mar de 2,252 metros. Cuenta con una superficie total de 109.924 Km2. Sus colindancias son: al norte con Tepotzotlán; al sur con Tlalnepantla de Baz y Atizapán de Zaragoza; al este con los municipios de Cuautitlán y Tultitlán, y al oeste con Nicolás Romero.

El municipio presenta una comunicación fluida con diferentes municipios y ciudades, a través de arterias regionales como son: Autopista México - Querétaro, México - Cuautitlán - Teoloyucan, Lechería - Chamapa - Toluca, Prol. Av. Teotihuacán - Lago de Guadalupe - Atizapán de Zaragoza, carretera Lechería - Tepojaco - Nicolás Romero y Calzada de Guadalupe a Cuautitlán

El municipio tiene una topografía cuyas principales elevaciones son el cerro de Barrientos con una altura de 2430 metros sobre el nivel del mar (msnm) y el cerro de Axotlán, de 2300 msnm, el resto del territorio presenta planicies y suaves lomeríos.
La superficie territorial está conformada por un área plana en la parte centro y norte del municipio; las áreas planas ocupan una extensión de 6,100 hectáreas las cuales están formadas por aluvión mientras en los lomeríos, que tienen una extensión de 4,700 hectáreas, forman el substrato por areniscas y tobas volcánicas.
Cuautitlán Izcalli tiene una altura promedio de 2,252 msnm, sus porciones más altas están ubicadas al sur con una máxima altura de 2430 msnm y la más baja se encuentra al occidente con 2,250 msnm, la cabecera municipal está a 2,280 msnm, a continuación se menciona la altitud de otras localidades principales:

NOMBRE ALTITUD (MSNM)
San José Huilango 2,300
Ejido Axotlán 2,270
Axotlán 2,270
San Francisco Tepojaco 2,320
Colonia San Pablo de los Gallos 2,290
Ejido El Rosario 2,290
Ejido San Martín Tepetlixpan 2,250

* Fuente Cuaderno Estadístico Municipal, INEGI edición 1996.

El terreno que ocupa el municipio de Cuautitlán Izcalli, geológicamente pertenece a la era Cenozóica de los períodos terciario (T) y cuaternario (Q), los tipos de roca por su origen son: sedimentaria (al), sedimentaria (uc) e ígnea extrusiva (a), aluvial 45.05% de la superficie, volcanoclástica 52.93% y andesita 2.02% respectivamente.
El terreno de Cuautitlán Izcalli presenta 3 fallas en los cerros de La Quebrada y Barrientos y una fractura en el Fraccionamiento de Bosques del Lago.
Como se mencionó anteriormente las áreas planas de la superficie del municipio están formadas por aluvión, en los lomeríos, el suelo está formado por areniscas y tobas volcánicas, por otra parte se tienen 193 hectáreas ocupadas por suelos residuales

Colinda al norte con Tepotzotlán y Cuautitlán México, al este con Cuautitlán México y Tultitlán, al sur con Tlalnepantla de Baz y Atizapán de Zaragoza; al oeste con Villa Nicolás Romero y Tepotzotlán.

Según el artículo 15 de Bando Municipal 2005 de Cuautitlán Izcalli, el territorio municipal tiene una extensión de 109.9km2 por lo que representa el 0.5% de la superficie del Estado de México.

Cuautitlán Izcalli cuenta con una orografía que consiste en lomajes inclinados orientados del este hacia el oeste, junto al poblado de San Juan Atlamica, en la colonia Bellavista, existe un pequeño cerro denominado "Cerro de la Cachucha".La región del lomerío se caracteriza por ser suave y con pequeños valles.

Por encontrarse en una provincia que pertenece al eje Neovolcánico, en la subprovincia con clave 57 denominada Lagos y Volcanes de Anáhuac, el sistema de topoformas consiste en lomeríos al Norte, Centro y Este en un 66.66% del territorio municipal y llanuras con lomeríos al Sur y Oeste en un 33.34% de la superficie territorial.

Existen importantes corrientes superficiales y cuerpos de agua, entre las primeras: el Río Cuautitlán que atraviesa el territorio municipal con una longitud de 10.98km, el Río Hondo de Tepotzotlán tiene como principales afluentes los arroyos Chiquito, Lanzarote y el Ocote y que sirve como límite entre este municipio y el de Tepotzotlán . los principales cuerpos de agua son : embalse Espejo de los Lirios; Bordo la Piedad; Presa el Angulo; Laguna de Axotlán, y la Presa Lago de Guadalupe este último recientemente decretado el 13 de Octubre de 2004 Área Natural Protegida, con categoría de Parque Estatal denominado "Santuario del Agua y Forestal Presa Guadalupe" con un perímetro de 17.5km.

Este municipio tiene climas templado subhúmedo con lluvias en verano, de humedad media C(w1) en un 30.60% de la superficie territorial y templado subhúmedo con lluvias en verano de menor humedad C(wO) en un 69.40% de la superficie municipal.

Cuenta con la temperatura promedio propia del clima templado subhúmedo cuya variación máxima alcanza los 27.8º centígrados y como mínima de 5º centígrados la media anual, se ubica en los 16º centígrados.

El régimen pluvial medio anual oscila entre los 600 y 800 mm. Y los principales meses de precipitación son: junio, julio, agosto y septiembre.

Durante los meses de noviembre a febrero se presentan con una frecuencia de 20 a 120 días las heladas en el municipio, las granizadas tienen una frecuencia de 0 a 10 al año, principalmente en los meses de julio y agosto.

El uso del suelo ha sido ganado por la urbanización con más del 40 por ciento de la superficie territorial municipal. En el uso pecuario, agrícola y forestal se emplea el 40 por ciento. El resto, está ocupado por la industria, cuerpos de agua, erosionado y de otros usos, con el 18.5 por ciento.

En el municipio predominan los siguientes tipos de suelos:

Cambisol: se localiza al centro y sureste, son suelos susceptibles a erosionarse, además de presentar acumulación excesiva de arcillas, carbonato de calcio, hierro y magnesio. Presentan problemas de drenaje interno.

Vertisol: se extiende en la mayor parte área municipal y se caracteriza por ser suelos arcillosos de color oscuro, fértiles que ofrecen en ocasiones problemas de mal drenaje.

Litosol: se observa en pequeñas áreas del centro, sur y oeste de la región; se caracterizan por una profundidad de perfil no mayor de 10 cm., cuyo material sustentador es generalmente tepetate.

Foezem: ocupa pequeñas áreas en el sur del territorio, caracterizado por color pardo, oscuro y grisáceo muy oscuro, que indican su riqueza en materias orgánicas y nutrientes.

Uno de los problemas mas reconocidos en los centros urbanos es el manejo de residuos sólidos municipales. La disposición de desechos en tiraderos a cielo abierto contaminación del suelo y mantos freáticos por la generación de lixiviados. Asi mismo provoca la proliferación de plagas como ratas o moscas; genera polvos que provocan enfer edades respiratorias, etc.

En Cuautitlán Izcalli la producción de asura oscila entre 350 y 390 toneladas diarias. La tendencia de generación de asura para el 2010 se calcula en aproxi ada ente 600 toneladas diarias.

La generación de residuos sólidos por sector, esti ada para Cuautitlán Izcalli hasta el año 2017 se aprecia en la figura nú ero 3.

La cabecera municipal denominada Ciudad Cuautitlán Izcalli, que comprenden los Fraccionamientos Urbanos: 1) Atlanta 1ª. Sección2) Atlanta 2ª. Sección3) Arcos del Alba4) Arcos de la Hacienda5) Bosques de la Hacienda 1ª Sección6) Bosques de la Hacienda 2ª Sección7) Campestre del Lago8) Colinas del Lago9) Cumbria 10) Ensueños11) Jardines del Alba12) Jardines de la Hacienda Norte13) Jardines de la Hacienda Sur14) Sección Parques15) Residencial La Luz16) Rincón Colonial17) Valle de la Hacienda

Las Colonias Urbanas: 1) Ampliación Ejidal San Isidro2) Bellavista3) Bosques de Morelos4) Bosques de Xhala5) Ejidal San Isidro6) Ejido El Socorro7) El Sabino8) El Tikal9) Francisco Villa10) Granjas Loma de Guadalupe11) Halcón Oriente12) Jorge Jiménez Cantú13) La Conasupo14) La Joyita15) La Perla16) La Piedad17) La Presita18) La Trampa19) Las Animas 20) La Aurora21) Las Auroritas22) Las Conchitas23) Loma Bonita24) Lomas del Bosque25) Los Pinos26) Luis Echeverría27) Mirador Santa Rosa28) San Isidro29) San José Buenavista30) San Pablo de los Gallos31) Santa María Guadalupe La Quebrada32) Santa Ma. Gpe. las Torres 1ª 33) Santa Ma. Gpe. las Torres 2ª 34) Santa Rosa de Lima35) Tres de Mayo36) Tres Picos37) Valle de las Flores

Los Fraccionamientos Habitacionales Urbanos: 1) Bosques del Lago2) Quebrada Centro3) Quebrada Ampliación4) Quebrada Sección Anáhuac 5) Lago de Guadalupe6) Unidad Cívica Bacardi7) Exhacienda San Miguel8) Los Pájaros

Las Unidades en Condominio: 1) Adolfo López Mateos2) Bosques de la Hacienda 3ª. Sección3) Bosques del Alba I4) Bosques del Alba II5) Consorcio Cuautitlán6) Elite Plaza - Unidad Fovisste y Tulipanes7) Fidel Velázquez8) Generalísimo José Ma. Morelos y P. Sur9) Generalísimo José Ma. Morelos y P. Nte.10) Hacienda del Parque11) Infonavit Norte 1ª 12) Infonavit Norte 2ª 13) Infonavit Sur "Niños Héroes"14) Infonavit Tepalcapa 15) Infonavit Zona Centro16) Manzana Cr III A y B17) Plaza Tepeyác18) Residencial Los Lirios19) San Antonio20) Unidad Campo 121) Unidad CTM NR1 Núcleos22) Unidad Ferrocarrilera23) Unidad Habitacional CTM24) Unidad Habitacional del Río25) Unidad México26) Valle Esmeralda27) Viveros II28) Unidad Tulipanes

Los Ejidos: 1) Axotlán2) El Rosario3) La Piedad4) San Antonio Cuamatla5) San Antonio Tultitlán6) San Francisco Tepojaco 7) San José Huilango8) San Lorenzo Río Tenco9) San Mateo Ixtacalco10) Santa Bárbara11) Santa María Tianguistengo12) Santiago Tepalcapa

Los Pueblos: 1) Axotlán2) La Aurora3) Huilango4) San Lorenzo Río Tenco5) San Mateo Ixtacalco6) Santiago Tepalcapa7) Santa María Tianguistengo 8) El Rosario9) San Francisco Tepojaco10) San Juan Atlamica11) San Martín Tepetlixpan12) San Sebastián Xhala13) Santa Bárbara

Los Fraccionamientos Industriales: 1) Complejo Industrial Cuamatla2) La Joya3) Parque Industrial Cuamatla 4) Parque Industrial La Luz5) Parque Industrial Cuautitlán